AF3Complex：基于AlphaFold 3的蛋白质复合物结构预测新突破
2025-8-1
本研究针对蛋白质复合物结构预测精度不足的问题，通过改进AlphaFold 3的MSA生成算法、开发界面特异性评分指标pIS，并创新性地引入配体信息动态调控策略，构建了AF3Complex模型。该模型在1091个蛋白质复合物测试中DockQ评分显著优于AlphaFold 3（0.586 vs 0.573），尤其在抗体-抗原和蛋白-肽段相互作用预测中表现突出，为生物大分子相互作用研究提供了新工具。
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